李吉甫也聽出來了，李純這是給兩個宗親台階下，也不便捅破，就說：
“陛下英明，如果追溯過往，不知要從哪年哪月算起，今年清查完畢以後，就從今年算起，這樣大家都沒意見。”
李純又說：
“這次清查多出來的土地和人口，全部要按照标準收取賦稅，同時也要取締有些地方胡亂給平民增加的稅賦，做到取之于民，用之于民，給底層人民減輕負擔。”
李吉甫覺得李純已經考慮的比較周全，當即領命而去。
李吉甫回去以後，首先派人到李諒和王士平原來庇護的地主那裡清查土地和人口，這些人還心存僥幸，又跑到兩個宗親那裡找關系。
李諒和王士平上次被李純敲打以後，内心緊張的半死，哪還敢跟這些人沾上關系，命人将他們趕走。
李吉甫還聲稱，哪個官員如果膽敢阻撓清查土地人口，甚至幫助他人隐匿，就派禦史台的人嚴查涉案的官員，隻要發現違法行為，嚴懲不貸。
在高壓态勢下，絕大部分人隻能老老實實配合朝廷的人口和土地清查活動，沒想到還是有人心存僥幸，企圖蒙混過關。
前面已經仁至義盡，敲打提醒到位，李吉甫這次就不客氣了，對一些參與隐匿土地和人口的地主和官員施行重罰。
李吉甫将那些隐匿的土地全部充公，隐藏的人口全部與地主脫離關系，對于涉案的官員交給禦史台嚴查，按照貪污金額的大小分别予以撤職、流放，甚至判入監牢。
經過幾個月的努力，朝廷共多清查出土地近三千萬畝，兩百多萬人口，并取締了一些地方擅自增加的賦稅，雖然朝廷總的征收賦稅沒有增加多少，但是确實減輕了底層百姓的負擔。
當然，由于還有很多藩鎮具有很大的獨立性，所以這次的土地和人口清查，主要在朝廷能夠直接控制的區域進行，對于一些強藩隐匿的土地和人口，李吉甫也是無可奈何。
總體來說，李純對于李吉甫開展的活動還是比較欣賞的，認為他剛柔并濟、恩威并施，基本達到了自己的預期目的，有效緩解了社會矛盾。
針對藩鎮的影響，李純也沒幻想一次性就把問題徹底解決，等後面削平藩鎮以後，再搞一次清查，就可以實現全國統一标準。
土地和人口清查的事告一段落後，李純開始将精力放在朝廷的機構改革上。李純即位初期就發現朝廷的機構設置有很多不合理的地方，但因當時的事情比較多，時機不成熟，就暫時放下了。
經過近兩年多的觀察和體驗，李純對唐朝的制度有了更加深入的了解，覺得可以首先對朝廷的中央機構進行改革。
在唐朝的官制設置上，雖然官員由高到低設置為一到九品，但是對高級官員控制比較嚴，一二品的大員不輕易授予，給的也是一些虛職，純屬擺設。
中書侍郎，門下侍郎，加同平章事，履行宰相職能，卻隻有三品，和各部尚書、各地節度使差不多，沒有一點權威，純粹就是相當于秘書長，對皇帝的好惡依賴太大，不利于獨立開展工作。
李純覺得要幹大事，就要依賴一大幫人才，各管一攤，協同配合，自己要把主要精力用在制定戰略和重點工作上，沒辦法事事操心，其他的事務就是要放權給一些有能力的大臣，讓他們大膽去幹，這樣才能多點開花、齊頭并進，開創大業。