信使帶着許墨的決定，如同離弦之箭，分别奔向京師和福建。守拙園并未因此而恢複往日的甯靜，反而像一座無形的中樞，開始高速運轉起來。許墨深知，空有決心遠遠不夠，必須拿出切實可行、直指要害的方略，才能在這錯綜複雜的危局中，劈開一條生路。
他閉門謝客，将自己關在書齋三日。案頭堆滿了各類卷宗、海圖、商會賬冊以及曆年對白蓮教的調查記錄。餓了便簡單用些粥飯，困了就在榻上小憩片刻，整個人的精氣神都凝聚在如何破解眼前困局之上。
三日後，書齋的門終于打開。許墨眼中帶着血絲，面容疲憊，但眼神卻亮得驚人。他面前攤開了三張寫滿密密麻麻小楷的紙，墨迹猶新。
第一策：《靖海平波疏》——緻嘉靖皇帝與兵部
此策專為應對“翻海蛟”之患。許墨并未空談忠義，而是提出了一個極其務實且大膽的“以守為攻，以海制海”的連環計：
暫避鋒芒，固守要點：承認當前水師難以與敵正面決戰，建議俞大猷部暫時放棄外海部分難以守衛的島嶼，集中兵力固守舟山、廈門、南澳等幾處關鍵基地和港口，确保大陸門戶不失。同時，在重要水道布設水雷（他稱之為“水底龍王炮”，并附上了簡易制作圖說）、沉船等障礙物，遲滞敵艦行動。
放開民間，以海養戰：這是最大膽的一條。他建議皇帝特準，在俞大猷水師控制下的幾個核心港口，設立“特許海貿區”，允許經過審查的民間商船（尤其是蘇杭商會這類信譽良好者）在繳納特殊關稅并承諾接受水師調遣的前提下，組織武裝商船隊進行有限度的海上貿易。所得利潤，部分用于補貼水師軍費，部分用于犒賞商船隊。此舉既可打破海盜的經濟封鎖，維持商路不絕，又能将民間強大的海上力量轉化為官方的輔助戰力。
懸賞刺探，分化瓦解：建議朝廷明發榜文，重金懸賞“翻海蛟”及其核心頭目的項上人頭，并鼓勵海盜内部人員反正。同時，派遣精幹細作，僞裝成商人或落魄水手，設法打入海盜内部，或收買其外圍人員，獲取情報，尋找其弱點及内部矛盾。
師夷長技，急造利器：強烈建議朝廷立即撥款，在福建、廣東等地設立“船械局”，不拘一格招募中西工匠，全力仿制并改進西夷火炮及艦船。尤其強調要發展靈活快速、裝備中小型火炮的“快蟹船”、“火龍船”，專司近海突擊和火攻。
第二策：《查奸固本策》——緻俞大猷及東南督撫
此策更為具體，直接指導俞大猷如何行動，并點明内部清查之關鍵：
戰術細化：将之前提到的“示弱誘敵、火攻近戰”戰術進一步細化。建議俞大猷選擇幾處水文複雜、暗礁密布的海域作為預設戰場，提前布置引火之物，并訓練熟悉水性的死士，專司火船操作和水下破壞。
内鬼篩查：明确指出内鬼可能存在的幾個環節：掌管水師布防圖的參謀、負責商船航線報備的市舶司官員、與海盜活動區域有貿易往來的沿海豪強。建議俞大猷聯合可靠的地方官員，以“整頓吏治”或“核查軍需”為名，進行秘密調查，重點關注近期行為異常、出手闊綽或與特定商号往來過密者。
情報共享：建議建立水師與特許商船隊之間的快速情報傳遞機制，商船在海上發現的敵情，可迅速報知水師，形成聯動。
第三策：《清源靖内方》——緻楊一清及北方相關官員，并抄送青州知府
此策針對“清水教”及草原勢力勾結之患：